一、病毒類疫苗的生產(chǎn)方法
不同病毒類疫苗的制備工藝各異，但主要程序相似，圖1為一般病毒類疫苗的制備工藝流程。
二、細(xì)菌類疫苗和類毒素的生產(chǎn)方法
細(xì)菌類疫苗和類毒素的制造雖均由細(xì)菌培養(yǎng)開始，但前者是用菌體作為進(jìn)一步加工的對(duì)象，而后者則對(duì)細(xì)菌所分泌的外毒素進(jìn)行加工。不同的菌苗，其制備工藝不盡相同，然而其主要程序相似。
三、疫苗的分離純化
目前廣泛使用和研發(fā)的疫苗（尤其是基因工程疫苗）本質(zhì)上多為蛋白質(zhì)，具備一般蛋白質(zhì)的性質(zhì)，分離純化與蛋白質(zhì)的分離純化具有相同之處。但與一般蛋白質(zhì)相比，疫苗的普及率高、用量大，且使用對(duì)象多為嬰幼兒和兒童，其分離純化相應(yīng)要求更高。尤其是很多疫苗（如乙肝表面抗原）由多聚亞基組成，其免疫原性大于各單個(gè)亞基免疫原性之和，分離純化過程更為復(fù)雜。蛋白質(zhì)疫苗和一般基因工程蛋白質(zhì)的最大不同在于其分子質(zhì)量往往高達(dá)幾十萬道爾頓甚至數(shù)百萬道爾頓。因而，疫苗的分離純化和一般蛋白質(zhì)相比又具有不同之處，并針對(duì)不同的疫苗制品選用不同的分離純化路線。但一般都包括兩個(gè)基本階段:初級(jí)分離和精制純化。初級(jí)分離階段的主要任務(wù)是分離細(xì)胞和培養(yǎng)液，破碎細(xì)胞釋放產(chǎn)物（如果產(chǎn)物在細(xì)胞內(nèi)），濃縮產(chǎn)物和去除大部分雜質(zhì)等。選用的分離方法包括細(xì)胞破碎技術(shù)、離心沉降和各種沉淀方法等。精制純化階段則選用各種具有高分辨率的技術(shù)以使產(chǎn)物和少量干擾雜質(zhì)盡可能分開，達(dá)到所需的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。超速離心技術(shù)和各種層析技術(shù)成為當(dāng)前達(dá)到此目的的主要方法。
為獲得免疫原性好、保護(hù)性強(qiáng)、毒副作用小的疫苗，早期的純化工藝依據(jù)物質(zhì)的分子量、密度和表面電荷的不同來分離疫苗，往往以密度梯度離心為主，輔之以超濾、沉淀等技術(shù)，如我國(guó)乙肝表面抗原和狂犬病疫苗的生產(chǎn)。用該工藝制備的疫苗純度和性狀能符合要求，不足之處是抗原回收率不高、操作繁瑣且周期長(zhǎng)、技術(shù)設(shè)備要求高，已逐漸為日臻成熟的層析技術(shù)所代替，在基因工程疫苗的研制中尤為如此。一般，傳統(tǒng)的離心、過濾和沉淀技術(shù)更多只是作為整個(gè)疫苗分離純化工藝的起始步驟，用于初步分離過程，層析技術(shù)與沉淀、離心等傳統(tǒng)分離技術(shù)的結(jié)合已逐漸成為疫苗分離純化的主流。